El Ente Autárquico Puerto La Paz y Márquez es un organismo público descentralizado con personería jurídica y autarquía funcional, encargado de la administración, gestión y desarrollo de la infraestructura y operativa portuaria de la terminal.
El Ente actúa bajo la órbita del Instituto Portuario Provincial de Entre Ríos (IPPER), autoridad de aplicación de la política portuaria provincial, articulando sus acciones en el marco del Ministerio de Planeamiento, Infraestructura y Servicios del Gobierno de Entre Ríos.
Autoridades del Ente Autárquico
Presidente: Marcelo Brunner
Administrador: Javier Betio
Dependencia Provincial
Instituto Portuario Provincial de Entre Ríos (IPPER): Martín César Anguiano (Presidente)
Ministerio de Planeamiento, Infraestructura y Servicios (Entre Ríos): Dr. Hernán Daniel Jacob (Ministro)